一文解决单细胞亚群注释的所有问题
第一步：亚群分类与注释。首先分亚群，通过样本比较发现新的细胞亚群或比例差异显著的亚群。接着对亚群进行细胞类型注释，结合细胞类型marker基因、细胞类型注释软件和文献数据进行综合注释。第二步：寻找疾病marker标志物。
CellTypist是一个用于自动注释人类组织中免疫细胞的工具，它整合来自不同组织的细胞数据，使用机器学习方法训练模型实现细胞类型的准确分类。该工具在不同细胞类型分类上的准确性达到约0.9，能识别包括T细胞、B细胞、单核巨噬细胞在内的不同细胞亚群。